ట్రాన్స్మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్స్ యొక్క నిర్మాణ లక్షణాలు మరియు వర్గీకరణ

అనేక రకాల ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు ఉన్నాయి మరియు వాటి వర్గీకరణ భౌతిక మరియు రసాయన లక్షణాలు, మూలాలు, ఇంజెక్షన్ మెకానిజమ్స్ మరియు బయోమెడికల్ అప్లికేషన్‌లపై ఆధారపడి ఉంటుంది.వాటి భౌతిక మరియు రసాయన లక్షణాల ప్రకారం, మెమ్బ్రేన్ పెనెట్రేటింగ్ పెప్టైడ్‌లను మూడు రకాలుగా విభజించవచ్చు: కాటినిక్, యాంఫిఫిలిక్ మరియు హైడ్రోఫోబిక్.కాటినిక్ మరియు యాంఫిఫిలిక్ మెమ్బ్రేన్ పెనెట్రేటింగ్ పెప్టైడ్‌లు 85%, హైడ్రోఫోబిక్ మెమ్బ్రేన్ పెనెట్రేటింగ్ పెప్టైడ్‌లు 15% మాత్రమే.

1. కాటినిక్ మెమ్బ్రేన్ పెప్టైడ్ చొచ్చుకుపోతుంది

కాటినిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు TAT, పెనెట్రాటిన్, పాలియార్జినిన్, P22N, DPV3 మరియు DPV6 వంటి అర్జినైన్, లైసిన్ మరియు హిస్టిడిన్‌లలో సమృద్ధిగా ఉండే చిన్న పెప్టైడ్‌లతో కూడి ఉంటాయి.వాటిలో, అర్జినైన్‌లో గ్వానిడైన్ ఉంటుంది, ఇది కణ త్వచంపై ప్రతికూలంగా చార్జ్ చేయబడిన ఫాస్పోరిక్ యాసిడ్ సమూహాలతో హైడ్రోజన్ బంధాన్ని కలిగి ఉంటుంది మరియు శారీరక PH విలువ యొక్క పరిస్థితిలో ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లను పొరలోకి మధ్యవర్తిత్వం చేస్తుంది.ఒలిగార్జినైన్ (3 R నుండి 12 R వరకు) అధ్యయనాలు అర్జినైన్ మొత్తం 8 కంటే తక్కువగా ఉన్నప్పుడు మాత్రమే పొర చొచ్చుకుపోయే సామర్థ్యాన్ని సాధించవచ్చని మరియు అర్జినైన్ మొత్తం పెరుగుదలతో మెమ్బ్రేన్ వ్యాప్తి సామర్థ్యం క్రమంగా పెరుగుతుందని తేలింది.లైసిన్, అర్జినైన్ వంటి కాటినిక్ అయినప్పటికీ, గ్వానిడిన్ కలిగి ఉండదు, కనుక ఇది ఒంటరిగా ఉన్నప్పుడు, దాని పొర వ్యాప్తి సామర్థ్యం చాలా ఎక్కువగా ఉండదు.ఫుటాకి మరియు ఇతరులు.(2001) కాటినిక్ కణ త్వచం చొచ్చుకొనిపోయే పెప్టైడ్ కనీసం 8 ధనాత్మకంగా చార్జ్ చేయబడిన అమైనో ఆమ్లాలను కలిగి ఉన్నప్పుడే మంచి పొర వ్యాప్తి ప్రభావాన్ని సాధించవచ్చని కనుగొన్నారు.పెనెట్రేటివ్ పెప్టైడ్‌లు పొరలోకి చొచ్చుకుపోవడానికి సానుకూలంగా చార్జ్ చేయబడిన అమైనో యాసిడ్ అవశేషాలు చాలా ముఖ్యమైనవి అయినప్పటికీ, ఇతర అమైనో ఆమ్లాలు సమానంగా ముఖ్యమైనవి, W14 F లోకి మారినప్పుడు, పెనెట్రాటిన్ యొక్క చొచ్చుకుపోయే సామర్థ్యం పోతుంది.

కాటినిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌ల యొక్క ప్రత్యేక తరగతి న్యూక్లియర్ లోకలైజేషన్ సీక్వెన్స్‌లు (NLSs), ఇందులో అర్జినైన్, లైసిన్ మరియు ప్రోలిన్ అధికంగా ఉండే షార్ట్ పెప్టైడ్‌లు ఉంటాయి మరియు న్యూక్లియస్‌కు న్యూక్లియస్‌కు రవాణా చేయబడతాయి.NLSలను సింగిల్ మరియు డబుల్ టైపింగ్‌గా విభజించవచ్చు, ఇందులో ప్రాథమిక అమైనో ఆమ్లాల యొక్క ఒకటి మరియు రెండు సమూహాలు ఉంటాయి.ఉదాహరణకు, సిమియన్ వైరస్ 40(SV40) నుండి PKKKRKV అనేది ఒకే టైపింగ్ NLS, అయితే న్యూక్లియర్ ప్రోటీన్ డబుల్ టైపింగ్ NLS.KRPAATKKAGQAKKKL అనేది మెమ్బ్రేన్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్‌లో పాత్రను పోషించగల చిన్న శ్రేణి.చాలా NLSలు 8 కంటే తక్కువ ఛార్జ్ సంఖ్యలను కలిగి ఉన్నందున, NLSలు ప్రభావవంతమైన ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు కావు, అయితే అవి యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లను రూపొందించడానికి హైడ్రోఫోబిక్ పెప్టైడ్ సీక్వెన్స్‌లతో సమయోజనీయంగా అనుసంధానించబడినప్పుడు ప్రభావవంతమైన ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లుగా ఉంటాయి.

నిర్మాణాత్మక-2

2. యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్

యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు హైడ్రోఫిలిక్ మరియు హైడ్రోఫోబిక్ డొమైన్‌లను కలిగి ఉంటాయి, వీటిని ప్రైమరీ యాంఫిఫిలిక్, సెకండరీ α-హెలికల్ యాంఫిఫిలిక్, β-ఫోల్డింగ్ యాంఫిఫిలిక్ మరియు ప్రోలిన్-ఎన్‌రిచ్డ్ యాంఫిఫిలిక్‌గా విభజించవచ్చు.

ప్రైమరీ టైప్ యాంఫిఫిలిక్ వేర్ మెమ్బ్రేన్ పెప్టైడ్‌లను రెండు వర్గాలుగా విభజించారు, MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) మరియు Pep - 1 (KETWWETWKREWKVKVKV) వంటి అణుధార్మిక పెప్టైడ్ సీక్వెన్స్ ద్వారా సమయోజనీయంగా అనుసంధానించబడిన NLSలతో వర్గం దీనిలో హైడ్రోఫోబిక్ MPG యొక్క డొమైన్ HIV గ్లైకోప్రొటీన్ 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) యొక్క ఫ్యూజన్ సీక్వెన్స్‌కు సంబంధించినది, మరియు పెప్-1 యొక్క హైడ్రోఫోబిక్ డొమైన్ అధిక పొర అనుబంధం (KETWWET WWTEW) కలిగిన ట్రిప్టోఫాన్ రిచ్ క్లస్టర్‌కు సంబంధించినది.అయినప్పటికీ, రెండింటి యొక్క హైడ్రోఫోబిక్ డొమైన్‌లు WSQP ద్వారా PKKKRKV అణు స్థానికీకరణ సిగ్నల్‌తో అనుసంధానించబడి ఉన్నాయి.ప్రైమరీ యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌ల యొక్క మరొక తరగతి pVEC, ARF(1-22) మరియు BPrPr(1-28) వంటి సహజ ప్రోటీన్‌ల నుండి వేరుచేయబడింది.

ద్వితీయ α-హెలికల్ యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు α-హెలిక్స్ ద్వారా పొరతో బంధిస్తాయి మరియు వాటి హైడ్రోఫిలిక్ మరియు హైడ్రోఫోబిక్ అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలు MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) వంటి హెలికల్ నిర్మాణం యొక్క వివిధ ఉపరితలాలపై ఉన్నాయి.బీటా పెప్టైడ్ ఫోల్డింగ్ టైప్ యాంఫిఫిలిక్ వేర్ మెమ్బ్రేన్ కోసం, బీటా ప్లీటెడ్ షీట్‌ను ఏర్పరుచుకునే దాని సామర్థ్యం దాని పొర యొక్క చొచ్చుకుపోయే సామర్థ్యానికి కీలకం, ఉదాహరణకు VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD)లో మెంబ్రేన్ సామర్థ్యం పరిశోధన ప్రక్రియలో, - అమైనో యాసిడ్ మ్యుటేషన్ అనలాగ్‌లు బీటా ముడుచుకున్న భాగాన్ని ఏర్పరచలేవు, పొర యొక్క చొచ్చుకుపోయే సామర్థ్యం చాలా తక్కువగా ఉంది.ప్రోలైన్-సుసంపన్నమైన యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్స్‌లో, పాలీపెప్టైడ్ నిర్మాణంలో ప్రోలిన్ అధికంగా సమృద్ధిగా ఉన్నప్పుడు పాలీప్రోలిన్ II (PPII) స్వచ్ఛమైన నీటిలో సులభంగా ఏర్పడుతుంది.PPII అనేది ప్రతి మలుపుకు 3.0 అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలతో కూడిన ఎడమ చేతి హెలిక్స్, ఇది ప్రతి మలుపుకు 3.6 అమైనో యాసిడ్ అవశేషాలతో కూడిన ప్రామాణిక కుడి చేతి ఆల్ఫా-హెలిక్స్ నిర్మాణానికి భిన్నంగా ఉంటుంది.ప్రోలైన్-సుసంపన్నమైన యాంఫిఫిలిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లలో బోవిన్ యాంటీమైక్రోబయల్ పెప్టైడ్ 7(Bac7), సింథటిక్ పాలీపెప్టైడ్ (PPR)n(n 3, 4, 5 మరియు 6) మొదలైనవి ఉన్నాయి.

నిర్మాణాత్మక-3

3. హైడ్రోఫోబిక్ మెమ్బ్రేన్ పెప్టైడ్ చొచ్చుకొనిపోతుంది

హైడ్రోఫోబిక్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు నాన్-పోలార్ అమైనో యాసిడ్ అవశేషాలను మాత్రమే కలిగి ఉంటాయి, అమైనో యాసిడ్ సీక్వెన్స్ యొక్క మొత్తం ఛార్జ్‌లో 20% కంటే తక్కువ నికర ఛార్జ్ ఉంటుంది లేదా ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్‌కు అవసరమైన హైడ్రోఫోబిక్ కదలికలు లేదా రసాయన సమూహాలను కలిగి ఉంటుంది.ఈ సెల్యులార్ ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ పెప్టైడ్‌లు తరచుగా పట్టించుకోనప్పటికీ, అవి ఫైబ్రోబ్లాస్ట్ గ్రోత్ ఫ్యాక్టర్ (K-FGF) మరియు ఫైబ్రోబ్లాస్ట్ గ్రోత్ ఫ్యాక్టర్ 12(F-GF12) కపోసి యొక్క సార్కోమా నుండి ఉన్నాయి.


పోస్ట్ సమయం: మార్చి-19-2023